罗马主教利欧满有雄心，在第五世纪大张旗鼓，宣称罗马主教的地位崇高，想将西方其他教区置于自己督导之下，宣告自己具有终审判决权。 由于罗马帝国渐渐衰弱，西罗马帝国于主后476年灭亡，罗马主教的地位在西部更加提升。 在第六世纪的贵格利时，教会进入中世纪，已经与早期教会的治理大相庭径。 贵格利的行政长官才，使得他更加扩大罗马主教的权力。 他没有野心要夺取众主教的权责，只是尽力帮助其他主教各尽其职。 他说「当一主教失职时，都会顺服罗马主教的裁决; 当他没有失职时，大家都是平等的，根据谦卑的秩序“。

当东方的主教失职，不听从省教区会议的定罪时，区会上诉东罗马皇帝，皇帝就指派贵格利来审理。 可见他没有企图干涉其他教区正常的权责运作，他只是照皇帝要求来帮助他人解决问题。 贵格利知道自己并非在众主教之上，乃是平等的，他也顺服教会会议的决议，接受皇帝指派处理教会里的争端。 他必须处理许多行政事项（例如救济饥荒，与蛮族求和），使得他自己叹息说，因未能全心投入监督的牧养工作，他感到痛苦。 他不想涉入其他教区事务，但顺从皇帝指派他的任务。 然而贵格利的领导有方，又继续坚持罗马主教的首位，使得罗马主教的权位发展壮大。

康堡主教长自从康堡会议（主后381年）之后，取代了亚历山大主教，成为东方教会的主要领袖。 罗马主教利欧大大表示不悦，此后双方争权不断。 贵格利的谦逊对照当时康堡主教长的骄傲（他想要作东罗马帝国全境教会的主教），是罗马主教中的昙花一现。 后来的继任主教，越来越抓权，教皇专制就逐渐展开了。 罗马与康堡争夺普世教会的主教长名号之争，最后在主后607年落幕，皇帝将此名号颁给罗马主教。 实质上，康堡主教长继续抗争，直到1054年东方教会与罗马正式决裂。 罗马主教在西方的领导日益壮大，第八世纪时法兰克国王皮平，获得罗马主教支持而篡位成功，皮平回报他，立法规定法国教会所有主教，都必须臣服于罗马主教。 皮平捐赠土地给罗马主教，其子查理曼大帝继续保护与支持，使得罗马主教有封地成君主。 西方教会到此实质上都臣服在罗马教皇之下。

西方教会越来越堕落在罗马教皇专制之下，一方面也要怪罪众主教的疏忽与懒散，没有尽力防止罗马教皇的侵权。 以致于到了十二世纪圣伯纳之时，根据他的见证，罗马教会已经败坏到不虔不义罪恶横行，不是羊群的青草地而是贼窝。 教会已经堕落到这悲惨的地步，敬虔的人对这大灾难感到非常伤痛。 天主教宣称统治普世教会的最高权力是在罗马教皇手中，还以许多造假的文件宣称，从早期教会以来就是罗马主教作元首，鼓吹教皇无误。 他们大言不惭鼓吹教皇至上论，完全与居普良所说「没有一个主教可以在其他主教之上」相反。 他们所辩护的教皇专制，正是贵格利所谴责定罪的。

现今在罗马已经没有真教会，为何说罗马教会是众教会之母？ 已经没有真正的主教，为何说罗马教皇（不忠于主教之职责）是众主教之首？ 罗马教会反对福音真理，已经失去其原先的纯正，现在沦丧为敌基督的殿堂（帖后2：4），也是那行毁坏的，说话夸大，折磨圣民（但7：25;启3：10;13：5）。 教皇在神的殿里高抬自己，窃夺神的荣耀（帖后2：3-7），是敌基督国度的掌旗人。 教会并非属地，不能与属地城市挂勾。 教皇专制是彻底违背教会治理。 有些教皇根本不相信神，不信圣经见证的基督，不信来生与末日复活。 例如十四世纪的教皇约翰22世公开宣称灵魂会朽坏，与身体同死，直到末日复活时。 出于被迫，他在临死前只肯有限度的收回此异端言论。 这样的教皇被称为使徒彼得的继承人？ 教皇无误？ 我们只能对这样的「彼得」说：「撒但，退我后边去罢」（太16：23）。

许多罗马教皇的道德败坏，争权夺利，能称为主基督的代理人？ 如果罗马在早期教会中是领头，现今连脚指头都算不上了！ 关于罗马教皇身边的红衣主教团，原来只是参谋低于主教，现今已经爬在众主教之上了。 总之，罗马主教宗座早已变质，不再像早期教会的罗马监督了。 先知玛拉基所说的，必应验在他们身上：「你们却偏离正道，使许多人在律法上跌倒。 你们废弃我与利未所立的约。 这是万军之耶和华说的。 所以我使你们被众人藐视」（玛2：8-9）。